Archivio storico - parte moderna (1864-1967)
I. Origine e dotazione, Eredità e legati - Donazioni (1900 - 2005)
I. Origine e dotazione - Case di residenza (1864 - 2005)
III. Amministrazione (1847 - 1979)
IV. Uffici e officine (1845 - 2006)
V. Servizi sanitario e di culto (1846 - 2002)
VI. Personale (1910 - 1990)
IX. Patrimonio attivo (1832 - 1979)
X. Passività (1864 - 1999)
Istituto Antirabico (1886 - 1993)
Associazione Nazionale Ospedali Italiani - Sezione Lombarda (1935 - 1945)
Associazione degli Ospedali Lombardi - ADOL (1946 - 1988)
Archivio storico - parte antica (1091-1863)
II. Prerogative (1357 - 2003)
V. Servizio sanitario e di culto ex Archivio Bianco (1476 - 1880)
XI. Patrimonio Attivo / Acque e loro edifici (sec. XIV - 1864)
Direzione medica ex archivio rosso (1791 - 1865)
Causa pia Macchi - parte antica (1413 - 1974)
Causa pia Secco Comneno (1375 - 1949)
Opera Pia Del Sesto - parte antica (1426 - 1975)