Core Facility

Laboratorio di Scienze OMICHE

Piattaforma di Genomica, Epigenomica e Trascrittomica
L’attività di ricerca si concentra sull’implementazione in Fondazione di tecnologie OMICHE basate su analisi di sequenziamento genico di nuova generazione (NGS), profilazione di trascrittomi (RNA-seq, single-cell RNA-seq e digital count Nanostring), analisi epigenetica sia con metodica NGS (Methyl-seq), che array (Infinium-Illumina).  Il laboratorio fornisce supporto ai ricercatori del Policlinico nello svolgimento delle analisi sopracitate facendosi carico totalmente o parzialmente dell’esecuzione di libraries, Quality control, sequenziamento e analisi secondaria e terziaria dei dati.
Obiettivo futuro è quello di integrare le linee dei gruppi di ricerca che sfruttano approcci bioinformatici che operano in Policlinico (inclusi per esempio approcci di radiomica ed analisi di immagini, intelligenza artificiale e machine learning per predizione di rischio clinico, approcci integrati di multi-omics), permettendo di aprire nuove linee e supporto di ricerca accessibili a tutti i gruppi dedicati sia alla clinica che di basic science. L’obiettivo ultimo è quello di rendere possibili attraverso lo studio di nuovi marcatori molecolari e risoluzione a singola cellula e capacità di calcolo, un approccio di medicina di precisione basato sullo studio dei meccanismi causali e terapie mirate alle caratteristiche del singolo individuo, la prossima rivoluzione di paradigma delle scienze mediche.  

 

omiche

  • Illumina NextSeq2000
  • Illumina NextSeq550 con add-on Infinium
  • Nanostring nCounter Flex
  • Chromium controller 10x Genomics
  • Cell culture room
  • HPC - High Perfomance Computing for data analysis (488 core, 8TB RAM, 180TB storage)